Monográfico. Análisis de Factores con R (una introducción)

El análisis de factores es una técnica de reducción de datos: menor dimensión mayor portentaje de varianza. Distinguimos el análisis factorial exploratorio del análisis factorial confirmatorio en función del conocimiento del número de factores a obtener. Este análisis está muy relacionado con el análisis de componentes principales pero no buscamos explicar el mayor porcentaje de varianza a partir de combinaciones lineales de variables, buscamos conjuntos de variables comunes entre si. Este análisis supone que hay un factor intrínseco a las variables a combinar. El proceso a seguir para este tipo de análisis sería:

1. Estudio de la matriz de correlaciones
2. Análisis factorial y representación de los factores
3. Factores por individuo

En este enlace tenemos una detallada descripción de esta metodología.

Para nuestro ejemplo vamos a trabajar con el mismo objeto de R sociodemo.RData que empleamos para el monográfico de introducción a la regresión logística. En este objeto disponemos de las tasas de paro desde 1996 a 2008, las tasas por edad y las tasas por sexo y la intención es reducir estás 16 variables a un subconjunto de factores lo menor posible que contengan la mayor variabilidad de los datos. Para facilitar el trabajo vamos a crear un objeto con las variables a estudiar:


lista=names(datos)
lista=subset(names(datos),substr(lista,1,4)=="paro"
| lista=="municipio" )
#Seleccionamos sólo paro y municipio
datos.1=subset(datos,select=lista)
summary(datos.1)

Os planteo una metodología muy sencilla para crear listas de variables con R y con esta lista ya tenemos un data.frame de partida para realizar nuestro estudio. Ahora tenemos que seguir los pasos antes indicados:

1. Estudio de la matriz de correlaciones:


cor(datos.1[,-1])
#Tenemos problemas con NAs
haz.cero.na=function(x){
ifelse(is.na(x),0,x)}
#Esta función hace 0 los NA
datos.1=data.frame(sapply(datos.1,haz.cero.na))
cor(datos.1[,-1])

Es evidente que tenemos un problema con valores NA. Los hemos resuelto con la función haz.cero.na (apuntadla) que nos transforma valores perdidos a 0. No es muy riguroso, de acuerdo, pero es una solución rápida y que no debe influir mucho en nuestro estudio. Vemos que los datos están altamente correlados (como era evidente) por lo que se espera que en pocos factores recojamos una buena cantidad de varianza.

2. Análisis factorial y representación de los factores:


library(stats)
analisis=factanal(datos.1[,-1],factors=6,rotation="none")
print(analisis, digits=2, cutoff=.2, sort=FALSE)

Empleamos la función factanal de la librería stats, esta función nos ofrece el análisis de factores por máxima verosimilitud. A la vista de los datos parece evidente que dos factores pueden ser suficientes porque contendrían en torno al 80% de la varianza. Replicamos el análisis para estudiar como se comporta con esos 2 factores:


analisis=factanal(datos.1[,-1],factors=2,rotation="none")
print(analisis, digits=2, cutoff=.2, sort=FALSE)

Efectivamente con dos factores ya superamos el 80% de la variabilidad. Los factores vienen dados por una matriz de cargas que en este caso es la que nos ofrece la salida de R:


  Factor1 Factor2
paro2008 0.96 -0.26
paro2007 0.95
paro2006 0.95
paro2005 0.93
paro2004 0.90 0.22
paro2003 0.89 0.29
paro2002 0.88 0.36
paro2001 0.86 0.42
paro2000 0.85 0.44
paro1999 0.84 0.43
paro1998 0.82 0.42
paro1997 0.77 0.41
paro1996 0.68 0.35
paro.hombres 0.75 -0.30
paro.mujeres 0.93
paro.16.24 0.67 -0.26
paro.25.49 0.92 -0.26
paro.50 0.83

Para comprender mejor como se crean es interesante resalizar una aproximación gráfica a su comportamiento:


#Objeto con matriz de cargas
cargas=analisis$loadings
#Graficamos las cargas
plot(cargas, type="p",col="red",lwd=8)
text(cargas,labels=subset(lista,substr(lista,1,4)=="paro"),
pos=1)

El paro en los últimos 3 años se asocia mucho mejor con mujeres y con edades comprendidas entre los 24 y 49 años, se ceba en mujeres y jóvenes. Para los hombres ha tenido un comportamiento más lineal, pero, al igual que la tasa de paro de los más jóvenes busca al paro en 2008 en el segundo factor del análisis. Para mejorar nuestro análisis puede proceder realizar una rotación de los factores:


analisis=factanal(datos.1[,-1],factors=2,rotation="varimax")
print(analisis, digits=2, cutoff=.2, sort=FALSE)
cargas=analisis$loadings
plot(cargas, type="p",col="red",lwd=8)
text(cargas,labels=subset(lista,substr(lista,1,4)=="paro"),
pos=1)

La rotación no nos ha aportado una mayor variabilidad en los factores, sin embargo parece que mejora la capacidad de explicación de los factores. Ahora hemos de terminar nuestro análisis.

3. Factores por individuo:


analisis=factanal(datos.1[,-1],factors=2,
rotation="varimax",scores="regression")
nrow(analisis$scores)

Con la opción scores (que por defecto está a none) le indicamos a la función que se creen las puntuaciones de cada factor. Ahora sólo tenemos que añadir estas puntuaciones al conjunto de datos de partida:


datos.1=cbind(datos.1,analisis$scores)
summary(analisis$scores)

Nuestro data.frame tiene dos nuevas variables que "reducen" las anteriores y podemos emplear en nuestros modelos. ¡Seguimos divulgando R, saludos!

4 comentarios en “Monográfico. Análisis de Factores con R (una introducción)

  1. Lee esta frase:

    Para nuestro ejemplo vamos a trabajar con el mismo objeto de R sociodemo.RData que empleamos para el monográfico de introducción a la regresión logística

    Saludos.

  2. Muchas gracias. En algunas partes me costó seguirlos (como cuando dicen que “A la vista de los datos parece evidente que dos factores pueden ser suficientes porque contendrían en torno al 80% de la varianza”, pero está que quien lee haga un poco su trabajo. De verdad que muy útil y muy sencillo.

  3. Señores Análisis y Decisión:

    Muchas gracias por su trabajo, como soy principiante en el R me ha sido muy util . Hice el seguimiento con mi propio conjunto de datos y conseguí generar casi tods los resultados( aunque los gráficos no me salen muy bonitos), excepto el de “Factores por individuo” y consecuentemente no puedo hacer el gráfico para compararlo con mis resultados de CP. Le mando lo trabajado solicitándole su gentil apoyo para la parte final.
    Atentamente, Doris Gómez

    >#Archivo con 6 variables donde las 5 primeras columnas corresponden a las v cuantitativas. Hice lo siguiente
    >af.gorrion af.gorrion
    > cargas.g cargas.g
    > plot(cargas.g, type=”p”,col=”red”,lwd=8)
    > af1.gorrion af1.gorrion
    >cargas.g plot(cargas.g, type=”p”,col=”red”,lwd=8)

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